黃子澄因株連九族，稗官野史，作品亦少流傳，遺稿散失殆盡。現見諸史志的，僅存《李景隆師敗》、《還洞庭》、《酬姚六丈》、《送劉醫士歌》和《大崗山廣慶寺記》等詩文17篇。

早年時期

黃子澄，名黃湜，以字行，分宜澧源(今為大崗山鄉大坑村)人。洪武十八年(公元1385年)中會試第一，殿試第三(俗稱探花)。伴讀東宮，累官至太常寺卿，曾與皇太孫談論削藩之事。皇太孫問黃子澄：“諸叔藩王皆擁重兵，如有變端，怎么辦?”黃子澄答道：“諸王僅有護兵，只能自守，倘若有變，可以以六師監之，誰能抵擋?漢朝七國不可謂不強，最后還是滅亡了。大小強弱之勢不同，而順逆之理更相異啊!”皇太孫認為他說得對。后來，每次叫黃子澄，必尊稱他為黃先生。

朱允炆即位后，任命黃子澄兼翰林學士之職，與齊泰同參國政，共謀削奪藩王權。齊泰打算首先向燕王朱棣動手，但黃子澄有不同意見，認為周、齊、湘、代、岷諸王，在先帝時候，就做了很多不法之事，削之有名。現在想要問罪，應該先從周王開始。

周王是燕王的母弟，削周是剪除燕王的手足。最后黃子澄的意見被采用，周王等五個藩王先后被削藩。朝廷用黃子澄和齊泰的計謀，調走燕王手下精兵，又在燕王府所在地北平一帶調動軍隊以監視燕王。

當年四月，朱棣回到北平后，就向朝廷告病，過了一段時間，病越來越重，居然成了病危。這場病并不是突發的，而是醞釀了相當長的時間。因為在即將到來的五月，朱棣有一件不想做卻又不得不做的事情。五月，是明太祖朱元璋的忌日，按照禮制朱棣應該自己前去，但朱棣敏銳地感覺到如果這次再去京城，可能就回不來了。可是父親的忌日不去也是不行的，于是他派長子朱高熾及另外兩個兒子朱高煦、朱高燧代替他祭拜。一下子派出三個兒子，除了表示自己重視此事外，另一個目的就是告訴朝廷，自己沒有異心。但當時的形勢已經很明，朱允炆擺明了就是要除掉藩王，此時把自己的兒子派入京城，簡直就是送去的人質。果然，朱高熾三兄弟一入京，兵部尚書齊泰就勸建文帝立刻將此三人扣為人質。建文帝本也表示同意，但黃子澄竟然認為這樣會打草驚蛇，應該把這三個人送還燕王，表明朝廷并無削藩之意，以麻痹燕王。

建文帝拿不定主意，此時魏國公徐輝祖出來說話，按親戚關系算，這三個人都是他的外甥，他看著此三人長大，十分了解此他們的品行，他對朱允炆進言，絕對不能放這三個人回去，因為此三人不但可以作為人質，而且都身負大才，如若放虎歸山，后果不堪設想。緊接著，徐輝祖特別說到了朱高煦這個人，他告訴朱允炆，在他這三個外甥中，朱高煦最為勇猛過人也最為無賴，他不但不會忠于陛下，也不會忠于他的父親。可是決定權在建文帝手中，他最后作出決定，放走了朱高熾三兄弟。

靖難之役

不久朱棣便在建文元年(公元1399年)七月起兵叛亂，上書朝廷指稱黃子澄和齊泰為奸臣。 明惠帝派老將耿炳文討伐，初戰不利。明惠帝聽從黃子澄的建議，以曹國公李景隆接替耿炳文，齊泰極力反對但無效。李景隆接任后，表現更令人失望，屢戰屢敗，損失數十萬人。朱棣乘著李景隆戰敗之時，上書朝廷，極力批評黃子澄和齊泰，明惠帝便免去二人官職，但仍暗中與二人議事。建文二年(公元1400年)，李景隆在濟南戰敗后被撤換，明惠帝赦免了他，黃子澄哭著請求明惠帝治李景隆的罪，明惠帝沒有接納，黃子澄便說：“大勢已去了，我舉薦景隆誤國，萬死不足贖罪!”

當盛庸在建文二年(公元1400年)十二月在東昌大破燕軍后，明惠帝在建文三年(公元1401年)正月恢復了黃、齊二人的官職，可是在三月盛庸在夾河戰敗后又再次免去二人官職。

城破被殺

建文四年(公元1402年)，燕軍逐漸逼近南京，明惠帝謀求與朱棣談和，便把黃子澄和齊泰眨謫到外地，仍密令二人募兵。南京陷落前，明惠帝召黃子澄回京，未至而南京已失守。黃子澄密謀繼續反抗朱棣，行蹤被人告發，因而被捕。

后燕王朱棣(即明成祖永樂帝)親自審問，黃子澄抗詞不屈，被肢解而死。后收黃子澄遺骨葬昆山縣(屬今江蘇省)馬鞍山下。明正德十五年(公元1520年)，黃子澄始得昭雪。清乾隆年間，追謚忠愨。